Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHCHD3Q9NX63 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms