Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms