Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASSF1Q9NS23 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms