Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MMP26Q9NRE1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP26Q9NRE1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms