Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 XRCC5-207ENST00000471649 610 ntTSL 26.79□□□□□ -1.329e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 MUC4-221ENST00000480843 16245 ntTSL 56.77□□□□□ -1.329e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.339e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 MUC4-214ENST00000470451 16169 ntTSL 56.75□□□□□ -1.339e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 MUC4-208ENST00000462323 16197 ntTSL 56.69□□□□□ -1.349e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 ALDH1A2-213ENST00000558603 407 ntTSL 36.68□□□□□ -1.349e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.379e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 MUC4-216ENST00000477086 16353 ntTSL 56.49□□□□□ -1.379e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 TOM1L1-212ENST00000572360 576 ntTSL 46.48□□□□□ -1.379e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.49e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 MUC4-220ENST00000479406 16075 ntTSL 56.28□□□□□ -1.49e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.439e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.459e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.479e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 HMGB1-207ENST00000468384 503 ntTSL 1 (best)5.81□□□□□ -1.489e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.549e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.579e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 TOM1L1-205ENST00000570499 596 ntTSL 35.17□□□□□ -1.589e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 NAPA-218ENST00000598615 379 ntTSL 37.48□□□□□ -1.219e-8■■■■■ 192.2
UTP3Q9NQZ2 NLRP1-205ENST00000544378 5281 ntTSL 215.82■□□□□ 0.125e-7■■■■■ 192.1
UTP3Q9NQZ2 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 192.1
UTP3Q9NQZ2 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.242e-9■■■■■ 192
UTP3Q9NQZ2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.895e-7■■■■■ 191.7
UTP3Q9NQZ2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 191.7
UTP3Q9NQZ2 BICD1-201ENST00000281474 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 191.7
UTP3Q9NQZ2 BICD1-202ENST00000395758 3194 ntTSL 1 (best)9.53□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 191.7
UTP3Q9NQZ2 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 191.7
UTP3Q9NQZ2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.363e-8■■■■■ 191.6
UTP3Q9NQZ2 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.153e-8■■■■■ 191.6
UTP3Q9NQZ2 POLR2A-209ENST00000617998 6751 ntTSL 1 (best)13.13□□□□□ -0.314e-8■■■■■ 191.5
UTP3Q9NQZ2 NISCH-205ENST00000467594 1014 ntTSL 216.36■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 191.5
UTP3Q9NQZ2 CFDP1-204ENST00000564793 457 ntTSL 37.78□□□□□ -1.169e-8■■■■■ 191.4
UTP3Q9NQZ2 CELSR2-201ENST00000271332 10534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 191.4
UTP3Q9NQZ2 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.28e-7■■■■■ 191.4
UTP3Q9NQZ2 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -08e-7■■■■■ 191.4
UTP3Q9NQZ2 TGFBR3-210ENST00000533089 6455 ntTSL 1 (best)8.32□□□□□ -1.088e-7■■■■■ 191.4
UTP3Q9NQZ2 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.138e-7■■■■■ 191.4
UTP3Q9NQZ2 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.158e-7■■■■■ 191.4
UTP3Q9NQZ2 TGFBR3-209ENST00000532540 3913 ntTSL 1 (best)7.4□□□□□ -1.238e-7■■■■■ 191.4
UTP3Q9NQZ2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.137e-7■■■■■ 191.2
UTP3Q9NQZ2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.177e-7■■■■■ 191.2
UTP3Q9NQZ2 ZFPM2-202ENST00000511341 1582 ntTSL 1 (best)21.56■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 191.1
UTP3Q9NQZ2 THOC2-206ENST00000433883 876 ntTSL 58.81□□□□□ -12e-6■■■■■ 191
UTP3Q9NQZ2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.96e-7■■■■■ 191
UTP3Q9NQZ2 CRELD2-209ENST00000483652 1994 ntTSL 1 (best)20.56■□□□□ 0.886e-7■■■■■ 191
UTP3Q9NQZ2 CRELD2-206ENST00000450207 963 ntTSL 519.63■□□□□ 0.736e-7■■■■■ 191
UTP3Q9NQZ2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.736e-7■■■■■ 191
UTP3Q9NQZ2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.736e-7■■■■■ 191
UTP3Q9NQZ2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.66e-7■■■■■ 191
UTP3Q9NQZ2 SHQ1-205ENST00000468371 4024 ntTSL 1 (best)6.38□□□□□ -1.394e-8■■■■■ 191
UTP3Q9NQZ2 DGKD-204ENST00000430834 5379 ntTSL 1 (best)17.39■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 190.8
UTP3Q9NQZ2 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 190.8
UTP3Q9NQZ2 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 190.8
UTP3Q9NQZ2 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 190.6
UTP3Q9NQZ2 ZMYND8-208ENST00000435836 670 ntTSL 59.46□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 190.3
UTP3Q9NQZ2 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.052e-48■■■■■ 190.2
UTP3Q9NQZ2 SPAG5-205ENST00000578230 335 ntTSL 37.16□□□□□ -1.264e-7■■■■■ 190.2
UTP3Q9NQZ2 SPAG5-204ENST00000577259 651 ntTSL 36.81□□□□□ -1.324e-7■■■■■ 190.2
UTP3Q9NQZ2 PLCB1-220ENST00000630757 857 ntTSL 310.36□□□□□ -0.754e-8■■■■■ 190.1
UTP3Q9NQZ2 PLCB1-229ENST00000637204 100 ntTSL 54.96□□□□□ -1.624e-8■■■■■ 190.1
UTP3Q9NQZ2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.199e-7■■■■■ 190
UTP3Q9NQZ2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.519e-7■■■■■ 190
UTP3Q9NQZ2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.229e-7■■■■■ 190
UTP3Q9NQZ2 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.019e-7■■■■■ 190
UTP3Q9NQZ2 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.059e-7■■■■■ 190
UTP3Q9NQZ2 GOT2-205ENST00000496461 981 ntTSL 214.59□□□□□ -0.079e-7■■■■■ 190
UTP3Q9NQZ2 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.099e-7■■■■■ 190
UTP3Q9NQZ2 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.159e-7■■■■■ 190
UTP3Q9NQZ2 GOT2-207ENST00000568368 516 ntTSL 413.55□□□□□ -0.249e-7■■■■■ 190
UTP3Q9NQZ2 FAM214B-201ENST00000322813 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.339e-7■■■■■ 190
UTP3Q9NQZ2 GOT2-201ENST00000245206 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.379e-7■■■■■ 190
UTP3Q9NQZ2 GOT2-206ENST00000564400 983 ntTSL 312.28□□□□□ -0.449e-7■■■■■ 190
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-226ENST00000481396 609 ntTSL 414.18□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 190
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-216ENST00000444471 680 ntTSL 314.18□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 190
UTP3Q9NQZ2 ASAP1-215ENST00000524299 550 ntTSL 411.14□□□□□ -0.632e-10■■■■■ 190
UTP3Q9NQZ2 ASAP1-212ENST00000521426 566 ntTSL 48.49□□□□□ -1.052e-10■■■■■ 190
UTP3Q9NQZ2 ASAP1-209ENST00000520927 742 ntTSL 58.15□□□□□ -1.12e-10■■■■■ 190
UTP3Q9NQZ2 MTHFR-213ENST00000641721 891 nt11.36□□□□□ -0.591e-10■■■■■ 190
UTP3Q9NQZ2 LZTS2-207ENST00000489526 802 ntTSL 220.76■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 189.9
UTP3Q9NQZ2 LZTS2-204ENST00000429732 701 ntTSL 518.39■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 189.9
UTP3Q9NQZ2 LZTS2-203ENST00000426584 816 ntTSL 317.3■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 189.9
UTP3Q9NQZ2 GLB1L2-202ENST00000529077 5621 ntTSL 1 (best)15.87■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 189.9
UTP3Q9NQZ2 LZTS2-206ENST00000481129 745 ntTSL 314.93□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 189.9
UTP3Q9NQZ2 MMAB-202ENST00000503497 546 ntTSL 521.36■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 189.9
UTP3Q9NQZ2 MMAB-201ENST00000420167 561 ntTSL 421.31■■□□□ 11e-6■■■■■ 189.9
UTP3Q9NQZ2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 189.9
UTP3Q9NQZ2 MMAB-208ENST00000542390 544 ntTSL 218.95■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 189.9
UTP3Q9NQZ2 DOCK9-201ENST00000339416 5653 ntTSL 211.06□□□□□ -0.647e-10■■■■■ 189.9
UTP3Q9NQZ2 MMAB-203ENST00000536760 650 ntTSL 210.34□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 189.9
UTP3Q9NQZ2 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.27e-10■■■■■ 189.9
UTP3Q9NQZ2 NPTN-206ENST00000563753 599 ntTSL 216.14■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 189.9
UTP3Q9NQZ2 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.069e-7■■■■■ 189.8
UTP3Q9NQZ2 ABCA11P-203ENST00000507854 1503 ntTSL 1 (best)11.4□□□□□ -0.599e-7■■■■■ 189.8
UTP3Q9NQZ2 ABCA11P-201ENST00000451020 1815 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.899e-7■■■■■ 189.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF721-206ENST00000515578 1679 ntTSL 1 (best)9.22□□□□□ -0.939e-7■■■■■ 189.8
UTP3Q9NQZ2 ABCA11P-204ENST00000514396 1423 ntTSL 1 (best)8.12□□□□□ -1.119e-7■■■■■ 189.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.119e-7■■■■■ 189.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.399e-7■■■■■ 189.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF721-204ENST00000507078 355 ntTSL 54.04□□□□□ -1.769e-7■■■■■ 189.8
UTP3Q9NQZ2 MAEA-206ENST00000503693 1182 ntTSL 1 (best)20.93■□□□□ 0.943e-7■■■■■ 189.7
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