Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB6Q9NP58 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms