Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F12Q9HCS2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F12Q9HCS2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F12Q9HCS2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F12Q9HCS2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F12Q9HCS2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F12Q9HCS2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F12Q9HCS2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F12Q9HCS2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F12Q9HCS2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F12Q9HCS2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F12Q9HCS2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F12Q9HCS2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F12Q9HCS2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F12Q9HCS2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F12Q9HCS2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F12Q9HCS2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F12Q9HCS2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F12Q9HCS2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms