Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMURF2Q9HAU4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMURF2Q9HAU4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMURF2Q9HAU4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMURF2Q9HAU4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMURF2Q9HAU4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms