Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBPF3Q9H094 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms