Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4CQ9C0C4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms