Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM5Q9C035 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM5Q9C035 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms