Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms