Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PI4K2AQ9BTU6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms