Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIOK1Q9BRS2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms