Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms