Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMCHL2Q9BQD1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms