Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM7Q9BQ49 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms