Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms