Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PHOX2BQ99453 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHOX2BQ99453 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHOX2BQ99453 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHOX2BQ99453 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHOX2BQ99453 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHOX2BQ99453 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHOX2BQ99453 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHOX2BQ99453 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHOX2BQ99453 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2BQ99453 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms