Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CDRT15Q96T59 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CDRT15Q96T59 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CDRT15Q96T59 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDRT15Q96T59 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDRT15Q96T59 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDRT15Q96T59 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDRT15Q96T59 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDRT15Q96T59 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDRT15Q96T59 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDRT15Q96T59 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDRT15Q96T59 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDRT15Q96T59 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDRT15Q96T59 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDRT15Q96T59 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDRT15Q96T59 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDRT15Q96T59 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDRT15Q96T59 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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