Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CICQ96RK0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CICQ96RK0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms