Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC74BQ96LY2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms