Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHDQ96IW2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms