Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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