Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPACA9Q96E40 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms