Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPTSSAQ969W0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTSSAQ969W0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms