Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX21Q969T3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms