Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HPS3Q969F9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms