Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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