Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms