Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBG9

SYNPR, Synaptoporin, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPRQ8TBG9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNPRQ8TBG9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms