Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms