Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms