Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHA9Q7RTU4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms