Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC29A4Q7RTT9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC29A4Q7RTT9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC29A4Q7RTT9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC29A4Q7RTT9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC29A4Q7RTT9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC29A4Q7RTT9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC29A4Q7RTT9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC29A4Q7RTT9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms