Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms