Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms