Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC9Q6ZRR7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms