Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIAT1Q6ZQX7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms