Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms