Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREML4Q6UXN2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms