Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms