Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms