Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms