Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC178Q5BJE1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms