Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms