Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf46Q504U0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms