Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HFEQ30201 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HFEQ30201 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HFEQ30201 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HFEQ30201 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HFEQ30201 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HFEQ30201 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HFEQ30201 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HFEQ30201 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HFEQ30201 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HFEQ30201 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HFEQ30201 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HFEQ30201 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HFEQ30201 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HFEQ30201 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HFEQ30201 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HFEQ30201 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HFEQ30201 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HFEQ30201 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HFEQ30201 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HFEQ30201 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HFEQ30201 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HFEQ30201 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HFEQ30201 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HFEQ30201 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HFEQ30201 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HFEQ30201 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HFEQ30201 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HFEQ30201 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HFEQ30201 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HFEQ30201 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HFEQ30201 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HFEQ30201 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HFEQ30201 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HFEQ30201 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HFEQ30201 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HFEQ30201 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms