Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GEN1Q17RS7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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GEN1Q17RS7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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GEN1Q17RS7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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GEN1Q17RS7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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GEN1Q17RS7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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GEN1Q17RS7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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GEN1Q17RS7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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GEN1Q17RS7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GEN1Q17RS7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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