Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FSCN1Q16658 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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